Index

A

add_obs() (matk.matk.matk method)

add_par() (matk.matk.matk method)

C

calibrate() (matk.matk.matk method) copy_sampleset() (matk.matk.matk method) corner() (matk.sampleset.SampleSet method)

corr() (in module matk.sampleset) (matk.sampleset.SampleSet method) cpus (matk.matk.matk attribute) create_sampleset() (matk.matk.matk method)

D

differential_evolution() (matk.matk.matk method) dist (matk.parameter.Parameter attribute)

dist_pars (matk.parameter.Parameter attribute)

E

emcee() (matk.matk.matk method)

expr (matk.parameter.Parameter attribute)

F

forward() (matk.matk.matk method)

H

hist() (in module matk.sampleset)

I

index_start (matk.sampleset.SampleSet attribute)

indices (matk.sampleset.SampleSet attribute)

J

Jac() (matk.matk.matk method)

L

levmar() (matk.matk.matk method) lhs() (matk.matk.matk method)

lmfit() (matk.matk.matk method)

M

main_effects() (matk.sampleset.SampleSet method) make_workdir() (matk.matk.matk method) matk (class in matk.matk) matk.matk (module) matk.observation (module) matk.parameter (module) matk.pest_io (module)

matk.sampleset (module) MCMC() (matk.matk.matk method) minimize() (matk.matk.matk method) model (matk.matk.matk attribute) model_args (matk.matk.matk attribute) model_kwargs (matk.matk.matk attribute)

N

name (matk.observation.Observation attribute) (matk.sampleset.SampleSet attribute) nominal (matk.parameter.Parameter attribute)

nomvalues (matk.matk.matk attribute)

O

Observation (class in matk.observation) obsnames (matk.matk.matk attribute) (matk.sampleset.SampleSet attribute)

obsvalues (matk.matk.matk attribute) obsweights (matk.matk.matk attribute)

P

panels() (matk.sampleset.SampleSet method) Parameter (class in matk.parameter) pardict() (matk.sampleset.SampleSet method) pardist_pars (matk.matk.matk attribute) pardists (matk.matk.matk attribute)

parmaxs (matk.matk.matk attribute) parmins (matk.matk.matk attribute) parnames (matk.matk.matk attribute) (matk.sampleset.SampleSet attribute) parstudy() (matk.matk.matk method) parvalues (matk.matk.matk attribute)

R

rank_parameter_frequencies() (matk.sampleset.SampleSet method) read_par_files() (in module matk.pest_io) read_sampleset() (matk.matk.matk method) recarray (matk.sampleset.SampleSet attribute)

residual (matk.observation.Observation attribute) residuals (matk.matk.matk attribute) results_file (matk.matk.matk attribute) run() (matk.sampleset.SampleSet method)

S

SampleSet (class in matk.sampleset) savetxt() (matk.sampleset.SampleSet method) seed (matk.matk.matk attribute) setup_bounds() (matk.parameter.Parameter method) sim (matk.observation.Observation attribute)

simdict (matk.matk.matk attribute) simvalues (matk.matk.matk attribute) sse (matk.sampleset.SampleSet attribute) ssr (matk.matk.matk attribute) subset() (matk.sampleset.SampleSet method)

T

tpl_write() (in module matk.pest_io)

V

value (matk.observation.Observation attribute) (matk.parameter.Parameter attribute)

vary (matk.parameter.Parameter attribute)

W

weight (matk.observation.Observation attribute) workdir (matk.matk.matk attribute)

workdir_base (matk.matk.matk attribute) workdir_index (matk.matk.matk attribute)